Как сообщили в администрации Тобольска, в формировании фонда будущего музея участвуют коллекционеры со всей России. В наличии уже имеются предметы мебели. Поиск каких-либо личных вещей ведется по всей стране. Тобольский историко-архитектурный музей-заповедник активно сотрудничает с частными собирателями.
Музей разместится в здании губернской классической мужской гимназии в нижнем посаде (улица Розы Люксембург, 14). Здесь учился Менделеев, а его отец Иван Павлович служил директором. Кроме того, здесь же проходил обучение, а затем преподавал автор поэтической сказки «Конек-Горбунок» Петр Ершов.